Zalgiris ile ilk olarak 1993 yılında Kupa 1’de İkinci Eleme Turu’nda karşılaşan Anadolu Efes ilk maçta rakibini deplasmanda 77-60 mağlup etti. Takımımız ikinci maçı İstanbul'da 72-57 kaybetmesine rağmen averaj ile bir üst tura yükseldi.

İki ekibin 1999 yılında Kupa 1’de çeyrek finaldeki eşleşmesinde Zalgiris iki maçtan da galip ayrıldı.

Anadolu Efes Euroleague 2012-13 sezonu ilk turunda rakibine iki kez mağlup olurken, aynı sezon Top 16 turunda oynanan ilk karşılaşmayı Anadolu Efes 56-52, ikinci karşılaşmayı ise Zalgiris 79-71 kazanan taraf oldu. Geçtiğimiz sezon ilk turun dördüncü haftasında karşı karşıya gelen iki ekibin mücadelesinden 72-61’lik skor ile galip ayrılan taraf Anadolu Efes olurken, dokuzuncu haftada Litvanya’da oynanan karşılaşma ise 65-63 Zalgiris lehine sona erdi.

Efes rakibi ile İstanbul’da oynadığı beş karşılaşmada iki galibiyet, Litvanya’da oynadığı beş karşılaşmada ise bir galibiyet elde etti.